近日，中国热科院橡胶所在橡胶草遗传图谱构建和含胶量QTL发掘方面取得重要进展，通过全基因组重测序技术构建了国际上首个橡胶草高密度SNP（Single nucleotide polymorphism, 单核苷酸多态性）遗传图谱，并结合作图群体的含胶量数据，定位了6个含胶量相关QTL（Quantitative trait locus，数量性状位点）。该研究为橡胶草含胶量相关分子标记的开发、分子标记辅助育种和功能基因图位克隆提供了信息基础和技术支持。

该团队以两个含胶量差异大的橡胶草株系杂交构建的F1代群体作为作图群体，利用“双假测交”策略采用全基因组重测序技术开发SNP标记，基于橡胶草染色体水平上的全基因组信息，成功构建国内外第一个橡胶草高密度SNP遗传图谱。该遗传图谱由12680个bin构建的9个连锁群组成，包含322,439个SNP。遗传图谱的总遗传距离为34,220.75 cM，平均遗传距离2.70 cM。结合 F1代作图群体的含胶量数据，利用复合区间作图法共检测到6个含胶量相关QTL。其中，在LG06/ChrA06 （第6号连锁群/第6号染色体）上，具有2个最高LOD （Logarithm of odds）值的QTL彼此接近，解释了表型贡献率的48.27%，表明其可能是影响橡胶草含胶量的主要区域，并对该区域包含的基因也进行了初步分析。

橡胶是世界四大工业原料之一，巴西三叶橡胶树一直是天然橡胶的主要来源，但由于种植面积限制、生产成本增加、遗传背景狭窄和病虫害严重等因素，橡胶生产逐渐难以满足需求。因此，开发生产天然橡胶的替代资源具有重要的战略意义和经济价值。橡胶草又称俄罗斯蒲公英，其根部橡胶含量高，品质优良，是近年来备受关注的重要产胶作物之一。目前，我国橡胶草种质较少且橡胶草种质的含胶量普遍较低，不能满足橡胶草产业化发展要求。因此，筛选和创制高含胶量橡胶草是目前主要的育种目标。

相关研究成果以Construction of the first high-density SNP genetic map and identification of QTLs for the natural rubber content in Taraxacum kok-saghyz Rodin为题发表于《BMC Genomics》。中国热科院橡胶研究所杨玉双副研究员为论文第一作者，刘实忠研究员为论文通讯作者。该项研究得到国家自然科学基金项目和中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资助。（文/中国热带农业科学院橡胶研究所 原文标题/中国热科院成功构建国际上首个橡胶草高密度SNP遗传图谱）

橡胶草SNP遗传图谱

含胶量相关QTL定位图